重大研究计划“西部能源利用及其环境保护的若干关键问题”的主要科学目标是立足于科技前沿关键问题的探索，服务于国家（特别是西部）需求，从领域综合与学科交叉的角度，在全国与地域相结合层次上，围绕西部能源资源开发利用战略研究、传统能源与新能源利用基础和西部能源工程的若干科学问题三大核心科学主题组织开展研究。通过计划的实施，为西部发展及相关的重大工程做出创新性贡献，为形成一个更加完整和更接近国家需求的西部开发战略提供科学依据，进一步提高我国在能源与环境领域以及可持续发展中解决重大科学问题的能力。